在人民解放军的强大压力下，国民党在是否固守新海连地区的问题上产生了重大分歧。蒋介石总统府参军长薛岳建议重点守青岛，将驻守新海连的第44军撤至青岛，必要时放弃新海连地区。而何应钦则恰恰相反，主张放弃青岛，将青岛的两个军调到海州，重点守新海连。蒋介石则主张同时固守。同时认为驻守海州的国民党军力量不足，需要另调部队增防。

1948年11月2日上午，徐州剿总刘峙电告驻守新海连国民党第九绥靖区司令李延年，要求李延年固守海州，国民党第100军周志道部正连夜赶往海州。但随着淮海战场形势的变化，第100军中途向西折回西新安镇（今徐州新沂市）。李延年在新浦闻听哀叹：“举棋不定，亡国之征。”5日夜里，李延年又接刘峙来电，决定在6日撤退，放弃新海连地区。 

6日凌晨，李延年召集部属及新海连国民党地方行政官员等宣布放弃新海连，驻守海州的王泽浚第44军西进加入淮海战场（后并入黄伯韬第七兵团，除一部投诚外，其余在碾庄战役中被歼），淮北税警办事处主任王天雄、税警处副主任邱国梁率驻堆沟、洋桥、徐圩、东、西陬山、新浦、板浦、大浦、猴嘴等处外线税警部队，向连云港和后云台山要隘集中，据守连云港港口，掩护军用物资装备和行政机关人员等从海上撤逃。

国民党军队仓惶撤逃时，新海连地区呈现无政府状态。一些国民党镇、保组织“自卫队”持枪抢劫，少数敌特分子和其他坏分子暗中煽动破坏，造成社会极度混乱。

由于敌军撤离的非常突然，我军外围主力部队无法及时进城。7日上午8时许，新海武工队在中共新海工委书记梁如仁率领下开进海州、新浦，受到徐敬甫、张晋阶、王友芝等工商界人士和群众的热烈欢迎。新浦商会会长徐敬甫在欢迎讲话中，向新海工委提出了维持社会秩序、原货币流通使用及帮助解决通水通电等请求。梁如仁向市民和工商界宣讲形势和共产党的城市政策，希望早日恢复生产和营业，安居乐业。

8日，鲁中南第六军分区政委谷牧带军分区机关进驻新浦、海州。苏北第六军分区部队火速挥师北上，准备策应淮海战役。11月6日占领灌云县城板浦。中共淮北盐特委、盐务局和盐警团也西过灌河，沿盐场西进，至7日，盐场全境解放。同日上午，第六军分区第三团一营进入新浦、海州协助地方部队维持市区秩序。其他主力部队向西追击国民党税警部队。当晚进抵墟沟以南的马山、汪店、平山一带，直逼连云港。

这时，退至港口的国民党税警部队已溃不成军，退至连云港后，无力掩护军用品由海上撤逃，而是一个劲地与“国军”争夺船只逃命。但敌水陆交通指挥所强行控制船只与码头，盐务局和税警部队无法利用，经国民党淮北盐务局副局长朱宝岑的乞求，始允在“万民”轮上划出一小部分舱位给盐务局使用。盐务局人员与家属得此消息，蜂拥而上，争相逃命。

至8日晨，码头上集中有敌海军、第九绥靖公署部分官员和税警官兵以及受骗群众等共有五六千人，乱作一团，蜂拥抢先登船逃命。由于船身靠岸一边侧重，船身倾斜，摇摇欲覆，码头也由于腐朽不堪，加之人员拥挤，塌落坠海。

8日中午，苏北第六军分区副司令吴大林亲自率第一团和灌云独立团为先头部队，向连云港发起攻击，占领了墟沟、孙家山，打开了进攻连云港的大门，与北路鲁中南第六军分区第一团、第二团和东海独立团会合，共同追歼向连云港逃窜的敌人，苏北第六军分区司令赵海峰和雷铁鸣副政委率第二团随后跟进。

9日，南北两路部队合击连云港残敌，歼敌2000余人，解放了连云港。10日深夜，渔民张志福等10多人摸到连岛庙前湾，缴了逃到岛上的国民党盐警一个中队100余人的枪支，次日迎接解放军上岛。

至此，新海连地区全境解放。