患儿和隐性感染者为主要传染源，手足口病隐性感染率高。肠道病毒适合在湿、热的环境下生存，可通过感染者的粪便、咽喉分泌物、唾液和疱疹液等广泛传播。

密切接触是手足口病重要的传播方式，通过接触被病毒污染的手、毛巾、手绢、牙杯、玩具、食具、奶具以及床上用品、内衣等引起感染；

还可通过呼吸道飞沫传播；

饮用或食入被病毒污染的水和食物亦可感染。

婴幼儿和儿童普遍易感，以5岁以下儿童为主。

可引起手、足、口和臀等部位的疱疹，病程约为4～8天；大部分患者可无明显的临床症状，个别患者可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症。

一般仅需对症治疗，预后良好；极少数病例可有脑炎、心肌炎、肺水肿、弛缓性麻痹等并发症；个别危重病人可因多种原因导致死亡。

保持良好的个人卫生习惯是预防手足口病的关键。勤洗手，不要让儿童喝生水，吃生冷食物。儿童玩具和常接触到的物品应当定期进行清洁消毒。避免儿童与患手足口病儿童密切接触。

接种EV-A71型灭活疫苗，仅可用于6月龄～5岁儿童预防EV-A71感染所致的手足口病，基础免疫程序为2剂次，间隔1个月，鼓励在12月龄前完成接种。

但是有一说一，对于其他能引起手足口病的病毒，目前的疫苗是没有防护作用的。